1.滤材的选用：首先按照所要过滤的流体化学名称，依化学配合禁忌找出可用的滤材，再针对其操作温度，操作压力，酸碱值，操作条件(如，是否须要耐受蒸汽，热水或化学品杀菌等)，逐一评估，并剔除不适用之滤材。用途也是一个重要的考虑因素，比方药品、食品或化妆品用之滤材必须是FDA准许的材质；超纯水则须挑选纯净、不含有释出物会影响比阻抗的滤材；过滤气体则须挑选疏水性材质以及是否需要"卫生级过滤"设计等等。

2.过滤精度：这是一个令人困扰的问题。比方，要除去肉眼可见的颗粒，要选用25微米过滤器；要除去液体中云状物，要选用1或5微米过滤器；要滤除较小的细菌则需0.2微米的过滤器。问题在于有两种过滤精度单位：精度／公称精度。精度是指能100%滤除所标示精度之颗粒。对任何一种过滤器而言，这几乎是一个不可能达到，而且不实际的标准，因为100%是一个大的值。市面上通称的过滤器如薄膜等，严格地说，只能称"趋近于精密"的过滤器,而其它则皆属于公称精度，公称精度，这才是主要的困扰所在:"公称精度并没有一个业者共同认定并遵行的标准"。也就是说甲公司可以把公称精度订在85-95%，而乙公司却宁可订在50-70%。换句话说，甲公司的25微米过滤精度可能等于乙公司的5微米，或者更细。对此问题，有经验的专业过滤器供应商会有助于过滤精度之选择是"试用"。

3.依照过滤温度时的粘度：专业过滤设备供应商可以计算出需要多大的过滤器，装多少支滤芯，每支滤芯承担多大的流速以及预测其初期压降若干。若能提供流体中杂质含量，甚至可以预估其过滤寿命。

 4.过滤系统的设计：这个标题牵涉范围较广，比方应该选用那一种压力来源，需要多大的压力才能将滤芯寿命完全运用，是否需要装两套过滤器并联，以适合连续性操作之系统，对粒径分布宽广的场合应如何搭配粗滤与精滤，系统中是否须要装逆止阀或其他装置等等。这些都需要使用单位与过滤器供应商密切配合，共同找出恰当的设计。 

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